Ні. При чищенні історії куки залишаються. Це зовсім різні речі. Історія — це просто послідовність сторінок, на які ви заходили і вона потрібна тільки для вашої зручності, а куки це файли, які можуть запитувати сайти і за ним ідентифікувати вас (наприклад, що б не довелося постійно вводити свій логін і пароль).